DISCOVERY STUDIO｜タンパク質から低分子まで、幅広い分野に対応する統合ソフトウェア

Discovery Studioは、ライフサイエンスの研究者が手にすることができるもっとも進んだソフトウェア・ソリューションです。ドラッグ・デザイン、ファーマコフォア・モデリング、タンパク質構造モデリング、分子シミュレーション等の業界標準となっているアプリケーションに対して、単一の環境からの統合的なアクセスを提供します。研究プロジェクトの策定からリード最適化まで幅広く対応するために、洗練された広範なアプリケーションを内包し、すべての機能はWindows, Linuxいずれの環境でも使用することができます。

また、Discovery StudioはAccelrysのサイエンティフィック・プラットフォームであるPipeline Pilot上で動作するため、必要なソフトウェアは、Accelrys製品でも、外部のソフトウェアでも、Discovery Studioの環境に統合化して使用することができます。また、ユーザーはDS Developer Clientを使用することにより、ワークフローの自動化、カスタマイズ等を行える非常に柔軟なアプリケーション環境を実現しました。

分子力場・シミュレーション: CHARMmによる分子力場計算により、エネルギー最適化、ダイナミクスシミュレーション、エネルギー計算、動径分布関数等、幅広い種類の計算を精密に実行できます。連続体溶媒モデルをサポートし、脂質膜モデルも使用可能です。ループ構造のモデリング、タンパク質側鎖のコンフォメーションサンプリング、また、分子力場のみによるレセプターへのリガンドドッキング機能も有します。
ファーマコフォア・モデリング: ファーマコフォアモデルのソフトウェア・ソリューションを提供した最初のベンダーとして、最先端の機能を使いやすいインターフェースから利用可能にしました。ファーマコフォアモデルは、リガンドベース、レセプター構造ベース、共晶体構造からの手動設置等、様々なアプローチによる作成が可能です。また、三次元データベースに対する高速検索、個々の化合物に対するマッチング等、モデルを使用した化合物探索の方法も柔軟に実行できます。ファーマコフォアフィーチャーは、ユーザーが定義したカスタムフィーチャーをフルに使用することができます。

タンパク質モデリング: MODELERを使用したホモロジーモデリングの機能をフルに実装し、構造未知のタンパク質の構造予測を業界標準のアルゴリズムにより容易に実行できます。タンパク構造は、ホモロジーの情報以外に二次構造情報、近接残基、ジスルフィド架橋等、既知の情報を生かした構造発生が可能です。また構造プロファイルによる予測構造の評価機能を有します。ホモロジーの探索に必要な、BLAST検索、配列アライメント、配列プロファイルの比較等、タンパク配列解析の機能も豊富に用意しました。
QSAR、ライブラリ解析: 200個以上のディスクリプタと6種以上の統計手法による豊富な統計モデル構築環境を用意しました。様々なデータ環境における予測モデル構築を可能にします。また、化合物ライブラリの作成、化合物ライブラリからの選別、ソート、ライブラリ同士の比較等、ライブラリ管理の機能も充実しています。